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探讨了多重序列比对和序列谱隐马尔可夫模型，讨论了隐马尔可夫模型的基本算法以及如何建立HMMs。
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LSS-DCA: A Fast Multiple Sequence Alignment with Divide-and-conquer Algorithm
LSS-DCA：一个快速的分治多序列对齐算法
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双序列比对是序列分析常用的方法之一，也是多序列比对和数据库搜索的基础。
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虽然空位罚分显著地影响多序列比对，但是并不清楚当空位以不同的方法编码和使用不同的重建算法时系统发育分析结果是否存在差异。
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